Συμμετέχουν 12 ομάδες της Handball Premier

Πραγματοποιήθηκε στα γραφεία της ΟΧΕ με διαδικτυακή μετάδοση η κλήρωση του 39ου Κυπέλλου Ανδρών 2020-2021

Α’ φάση (20 Απριλίου)
Βορράς
ΑΕΣΧ Πυλαίας- Φαίακας Κέρκυρας
ΠΑΟΚ- BiancoMonte Δράμα
Άνευ αγώνα στη Β’ φάση: Ζαφειράκης Νάουσας και Φίλιππος Βέροιας

Νότος
Διομήδης Άργους- ΑΣΕ Δούκα
ΑΕΚ- Άρης Νικαίας
Άνευ αγώνα στη Β’ φάση: HC Σαλαμίνα και Ιωνικός ΝΦ

Β’ φάση
Βορράς
ΠΑΟΚ ή Δράμα με Ζαφειράκη
Πυλαία ή Φαίακας με Φίλιππο

Νότος
Σαλαμίνα με ΑΕΚ ή Άρη
Διομήδης ή Δούκας με Ιωνικό

Final-4
1ος ημιτελικός
Σαλαμίνα ή ΑΕΚ ή Άρης με Διομήδη ή Δούκα ή Ιωνικός

2ος ημιτελικός
ΠΑΟΚ ή Δράμα ή Ζαφειράκης με Πυλαία ή Φαίακα ή Φίλιππο